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Test ADN non invasif pour savoir combien de poissons il y a dans l'eau

Test ADN non invasif pour savoir combien de poissons il y a dans l'eau

Tous les plans d'eau naturels contiennent de l'ADN appartenant à des entités vivantes telles que les animaux et les plantes. Serait-il alors possible de tester l'ADN de l'eau pour savoir combien de ces organismes y vivent? Les écologistes semblent le croire.

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Ils ont commencé à analyser activement les molécules d'ADN à base d'eau, appelées ADN environnemental, pour évaluer la distribution des macro-organismes. En tant que tel, des chercheurs de l'Institut national des études environnementales, de l'Université de Tohoku, de l'Université de Shimane, de l'Université de Kyoto, de l'Université de Hokkaido et de l'Université de Kobe, ont révélé une nouvelle méthode pour estimer l'abondance de la population de poissons en mesurant simplement la concentration d'ADN environnemental dans l'eau.

En effet, les organismes présents dans l'eau libèrent (ou libèrent) des molécules d'ADN et l'eau finit par les transporter et les dégrader. Cependant, la nouvelle méthode n'est pas infaillible car tous ces processus sont entrepris de manière complexe.

«Cela complique et limite l'approche traditionnelle de la quantification de la population basée sur l'ADN environnemental où la présence d'une relation définie entre la concentration d'ADN environnemental et l'abondance de la population a été critique», a expliqué dans un communiqué Keiichi Fukaya, associé de recherche à l'Institut national pour Environmental Studies et auteur principal de l'article.

"Nous pensions que ces processus fondamentaux de l'ADN environnemental, l'excrétion, le transport et la dégradation, devraient être pris en compte lorsque nous estimons l'abondance de la population grâce à l'ADN environnemental", a-t-il déclaré.

Les chercheurs ont ensuite adopté un modèle hydrodynamique numérique qui tient compte des processus pour imiter la distribution des concentrations d'ADN environnemental dans un plan d'eau naturel. Fukaya a expliqué qu'en résolvant ce modèle dans la «direction inverse», son équipe pouvait estimer la population de poissons en fonction de la distribution des concentrations d'ADN dans l'environnement.

Pour l'instant, la méthode semble fonctionner. Une étude de cas de Maizuru Bay, au Japon, a révélé que l'estimation de la population de maquereau japonais (Trachurus japonicus), réalisée par la méthode de Fukaya, était similaire à celle d'une méthode d'écho-sondeur quantitative.


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